前言：
由传染性肌坏死病*(IMNV)，引起的传染性肌坏死(IMN)病是对虾的许多病*性疾病之一，已在世界范围内传播，并造成重大经济损失。该病最初于年在巴西东北部发现，随后于年左右从印度尼西亚的爪哇岛报告。
一、IMNV将出现新的变异株
最近，印度西孟加拉邦报道了传染性肌坏死病，已发现四种虾对IMNV易感，包括南美白对虾(Penaeusvannamei)、蓝对虾(P.stylirostris)、斑节对虾(P.monodon)和圣保罗对虾(Farfantepenaeussubtilis)。
由IMNV引起的疾病进展缓慢，在整个养殖周期中死亡率持续较低，最终累积死亡率为40%-60%。由于其对养殖虾业的重大负面影响，及其经济影响，IMNV已被世界动物卫生组织列为重点虾病。
IMNV对巴西的经济影响很大，据估计年至年间导致的损失高达4.4亿美元。但是，目前需要紧急更新全球范围内最近的生产损失数据，以充分理解和更广泛的了解IMNV对虾养殖的影响，自年以来，巴西的帕拉州、马拉尼昂州、皮奥伊州、塞阿拉州、北里奥格兰德州、阿拉戈斯州、塞尔希培州和巴伊亚州都记录到异常死亡率，这些死亡率进展得更快，累积死亡率高达80%。通过分子和组织病理学技术进行的疾病诊断证实了，受感染动物中存在具有高病*滴度的IMNV。我们预测这些样本中出现了一种新的IMNV*株，与过去相比，它可能更具致病性，导致更高的死亡率。
今天，小编跟大家分享一项新的研究：新型传染性肌坏死病*(IMNV)变异株与巴西南美白对虾最近爆发的疾病有关，该研究确定的新型IMNV*株的全长基因组序列，并报告了它与来自巴西和印度尼西亚的其他IMNV*株的遗传关系。
二、研究设置
1、在这项研究中，我们使用下一代测序来确定来自塞阿拉州的新型IMNV菌株（Br-1）的完整基因组，该菌株来自年养殖周期，与异常高的死亡率有关。
2、本研究中检测的感染IMNV的南美白对虾，是年至年从商业虾类养殖池塘收集的，累计死亡率高达8%。这些池塘位于巴西东北部地区，大部分养虾都在那里进行。
3、来自受影响的虾平均重量为3.0克，这些虾采用分子生物学和组织病理学分析。
三、结果与讨论
1、关于对南美白对虾传染性肌坏死(IMN)病和白斑病样本的筛查，从年到年，许多巴西南美白对虾养殖区都报告了该疾病的暴发。近年来，由于白斑病的爆发，该国的养虾业遭受了重大损失。因此，我们最初推测疾病暴发，是由白斑综合症病*(WSSV)引起的白斑病(WSD)，尽管垂死虾的临床症状似乎与IMN更相似（图1A）。垂死的虾在腹节、尾足和尾扇变红（图1B）中显示出肌肉坏死的迹象。这些临床症状是IMN的特征。此外，在虾中还检测到淋巴器官球状体，显示出IMNV感染的组织学特征（图1C）。
图1：南美白对虾表现出典型的急性IMN体征，包括：局灶性至广泛性坏死，腹段肌肉发白；(B)腹部坏死和尾扇变红，IMNV感染的南美白对虾淋巴器官(C)腹横纹肌(D)组织切片的显微镜照片。
2、RT-PCR结果显示样本感染了不同程度的IMNV（拷贝数从26到3.6×10个11次方不等），并且未检测到WSSV或检测到的水平远低于IMNV。在初步检测到IMNV和WSSV之后，来自塞阿拉州、马拉尼昂州和皮奥伊州的一部分样本被送到亚利桑那大学的水产养殖病理学实验室。按照OIE推荐的方案，使用实时RT-PCR再次测试这些样本的IMNV。所有样品的IMNV检测均呈阳性，只有一个样品的IMNV呈阴性，来自塞阿拉州。
3、使用下一代测序对IMNV检测呈阳性的样本子集进行了测序。从我们对全基因组测序的分析来看，新IMNV基因组与参考基因组之间的同一性（百分比）为97.94%，表明这是一种新的IMNV*株。这种新的IMNV菌株被命名为Br-1，其全基因组系统发育表明它与来自印度尼西亚的IMNV菌株聚集在一起。Br-1全长基因组序列保藏于GenBank中，该数据库是由国家生物技术信息中心(NCBI)制作和维护，该中心隶属于美国国立卫生研究院(NIH)，是国际核苷酸序列数据库协作组织(INSDC)的一部分。
4、甲壳类动物疾病通过亲虾和虾苗的移动，而增加越境传播的风险，导致许多病原体作为全球
